1964年3月,河北大学设立日本研究室,同时创办《日本问题研究》刊物,作为研究室学术研究成果的载体。1966年受到文革的冲击,刊物被迫停刊。1973年3月,《日本问题研究》得以发行,仍作为内部刊物,铅印本,每年四期。
1987年1月起改为国内外公开发行,面向国内外开展学术研究与交流。公开发行后,编辑部开始有计划的组稿、约稿。。
2004年,河北大学世界经济专业博士点获得批准,高水平的研究者为《日本问题研究》提供了一流的研究成果,使刊物的学术质量得到了很大的提高。
2009年,刊物的主办单位变更,由河北大学日本研究所改为河北大学期刊社。经过期刊社的锐意创新,刊物质量得到进一步提高,在2011年由武汉大学中国科学评价研究中心组织的第二届中国学术期刊评价中,我校《日本问题研究》入选“RCCSE中国核心学术期刊”。